Ecological Systems Diagrams

This is an explanations of the first steps in modelling ecological systems. You can learn systems ecology practice with this program VENSIM PLE

Ecology of interacting populations

Ecology are the science of the interactions among species, there are many schools of ecology: Systems ecology (abiotical and biotical interactions) Population ecology (numbers in determined habitats and its dynamics) and Ecophysiology (how affect the environment to individuals). The video has a didactic purpose.

Molecular reactions or predator prey systems

The are very much similitudes between enzime-substrate reactions an ecological predator-prey models. Here you can see the analogy.

Predator-Prey in cellular automata

Predator-Prey systems can be implementes as ordinary differetial equations or by cellular automata models. Here we have a presentation of a Lotka-Volterra analog.

One dimensional cellular automata

This C code is a motor for implement the 1D cellular automaton.

Conway's

Schematic diagram of the stochastic Conway’s "Game of Life" model. Tables and graphs in boxes show impulse response and transfer functions of the corresponding units.

Interview with Dr. Francisco López (PhD) in French

The biologist and musician Francisco López. was my professor of dynamical systems ecology. He is a great scientist and musician, his "beautiful mind" make me a great influence biological ideas and his music inspire to me in using another areas of my brain. He was a member of my PhD exam, nothing more to say. For him my grateful for ever.

Clases de matemáticas y Club Telegenio

Desde hace un mes doy clases a un chico de 15 años que tiene la mente de un joven de más o menos 20 años. No suspende nada, al contrario saca todo sobresalientes, pero me encontró en internet y me llamó para avanzar en física y matemáticas. Se llama Héctor Sánchez Casas y es de Ciudad Real, es aficionado a la fisica, a la astronomía y al ajedrez. Gracias a él conocí el club Telegenio , una asociación mejicana, fundada y dirigida por Antonio Rada, un joven mejicano dedicado a la pedagogía de niños superdotados y con talento. Creo que los que tenemos ya ciertos conocimientos debemos esforzarnos por transmitirlos a los chavales receptivos, no toda la juventud está de botellón y dedicada a pintar graffitis de mal gusto. Hay chicos muy rescatables como Héctor y personas como Toño Rada se encargan de encauzar estas inquietudes y motivar estas nuevas vocaciones por la ciencia.

El juego de la vida de Conway con estructura de habitat ¿un sistema con atractores?

Ayer por la mañana puse una simulación a correr en Turbo C y lleva 24 horas. En esas 24 horas se ha producido un cambio de cuenca de atracción en el paisaje dinámico. Pude observar ayer como se tiró mas de 500 unidades de tiempo en densidad 0.02 y hoy por la mañana está en densidad 0.10. Como no tengo guardado un archivo de datos no se en que momento cambió de cuenca, pero nada lo ha perturbado, ha debido ser una inestabilidad mínima. Se trata de un ejemplo de caos en dynamical systems.

Rescatando el Turbo C 2.0

Una de las cosas que mas me fastidian de la informática es que hay que estar permanentemente "a la moda" porque cambian las librerías, los protocolos y muchas cositas que todas juntas hacen que uno no pueda aprender de una vez por todas. Dicen que el científico tiene que estar permanentemente aprendiendo nuevas cosas, pero es porque salen descubrimientos nuevos y nuevos modelos que hay que conocer. Sin embargo en informática no hay descubrimientos nuevos, hay nuevas sofisticaciones, nuevos protocolos. Tiene más que ver con el Derecho que con la Lógica. Yo he reciclado un PC, he instalado el Turbo C 2.0 y estoy simulando con él. Para lo mio me vale, no quiero hacer videojuegos ni ventanas espectaculares, simplemente probar algoritmos. He descubierto el libro "Simulating Ecological and Evolutionary Systems in C" de Wil Wilson y es una cosa bonita ver como sin tener que aprender 3445 lenguajes se pueden implementar de una vez por todas las cosas que interesan a un ecólogo.

Competition and MacArthur Model of resource

Now I m studying the competition models like MacArthur Model for resource subdivision ( COMPETITION Keddy 2001 Kluwer). He explored the possible mechanisms underlying the aij of the Lotka-Volterra equations, and the implications of these for the way in which organisms might subdivide the resources available to them. The problem is the realistic measured of competition matrix. MacArthur model is mostly based on statistical properties of Normal distribution. 

Materiales del Seminario

Nos lo pasamos muy bien en el seminario y presenté unas diapositivas de Power Point y ejecuté el programita ZOOCEN escrito en C con el que descubrí el "Competitor Release Effect ". Es muy importante para mi que la comunidad científica conozca y comprenda este fenómeno no lineal ya que esta es una linea de investigación muy fructífera que dará resultados importante. Tambien jugamos con el programa hecho en MATHEMATICA en colaboración con Tito Fernandez del Grupo de Dinámica de Sistemas Ecológicos de la UCM . La principal crítica de mi modelo para carnívoros fue que la matriz de competencia era simétrica, cosa que no era realista. Yo les expliqué a los colegas allí presentes, que lo que presentaba era un "Null Model" y que el programa ZOOCEN me permitía jugar con matrices diferentes y comparar los resultados con el null model. Muy amablemente el Dr. Pablo Ferreras me ha proporcionado biblografía para que construya matrices realistas

Seminario sobre Dinámica del Control de Poblaciones de Predadores

Hoy en el salon de actos del Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC - CSIC/UCLM/JCCLM) a las 13:00 en Ciudad Real (España) daré un seminario titulado "Dinámica del control de poblaciones". Hablaré de mi teoría "Competitor Release effect" desarrollada en colaboración con Franck Courchamp PhD de Paris y el Dr. Emilio Virgós de la URJC. Agradezco a los doctores Pablo Ferreras y Jorge Casinello por invitarme a contar lo que he hecho estos años y que por fin se ha materializado en la publicación de un artículo en la revista de impacto "Austral Ecology " y que continuará con una aplicación enviada a Wildlife Research para el fenómeno de la liberación de zorros en los cotos de caza donde el control no es selectivo hacia este carnívoro.

A este seminario espero que asistan ecólogos, veterinarios (IREC) y matemáticos (Fac. Químicas-UCLM). Espero veros y que me dejeis comentarios sobre que os ha parecido el seminario.

 

Actual Research Lines

 

 

Research Lines 2008

Ecological models of patterns of abundance and distribution of carnivores with Joan Barrull, Isabel Mate and Jordi Ruiz-Olmo. (Universidad de Barcelona).

Cellular differentiation in celular automata models with Dr. Juan Pablo de la Roche (Universidad de Santiago de Compostela)

Population Ecology of pests and alien species with Dr. Emilio Virgós (Universidad Reu Juan Carlos) , Dr. Franck Courchamp and Dr. Stephane Caut ( Ecologie, Systématique & Evolution, UMR CNRS 8079, France

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